一般在用缓冲液或者超声粉碎细胞后,得到的溶液都要高速离心(10000 g)10分钟,以去除不可溶的物质,这样在跑SDS-PAGE的时候不会出现拖带。
SDS-PAGE(聚丙烯酰胺凝胶电泳)是一种用于根据蛋白质混合物的大小分离其成分的分析方法。
该技术基于这样的原理,即带电分子将在电场中朝具有相反符号的电极迁移。常规电泳技术不能用于确定生物分子的分子量,因为物质在凝胶中的迁移率取决于电荷和大小。
为了克服这个问题,需要对生物样品进行处理,以使其获得均匀的电荷,然后电泳迁移率主要取决于尺寸。对于这种具有不同形状和大小的蛋白质分子,需要进行变性(在SDS的帮助下完成),以使蛋白质失去二级,三级或四级结构。被SDS覆盖的蛋白质带负电,并在上样时凝胶并置于电场中,它将朝着阳极(带正电的电极)迁移,并通过基于分子筛分作用的大小分开。通过染色(蛋白质特异性)技术进行可视化后,可以通过将蛋白质的迁移距离与已知分子量阶梯(标记)的迁移距离进行比较来计算蛋白质的大小。
首先准备一套蛋白电泳设备,蛋白质样品和marker上样到凝胶孔中,设置电压,启动电泳程序。
通常样本中会添加一种还原剂,如巯基乙醇或二硫苏糖醇(DTT)(在洗涤剂的存在下,如SDS),可以打开折叠蛋白质的二硫键;而样本中加入的SDS洗涤剂可以给所有蛋白质加上负电荷,从而将它们线性化成多肽。
聚丙烯酰胺则是多肽电泳分离的介质。多肽在电场的作用下向阳极方向泳动。
蛋白质电泳前,需用样品缓冲液处理,样品缓冲液中除SDS外,还有还原剂β-巯基乙醇,它可将蛋白质分子中的S-S(二硫键)还原.电泳样品制备时加热,就是为了加速这些组分与蛋白质的反应.
蛋白质在聚丙烯酰胺凝胶中电泳时,它的迁移取决于它所带电荷以及分子大小和形状等因素。1967年Shapiro等人发现,如果在聚丙烯酰胺系统中加入阴离子去污剂十二烷基磺酸钠(SDS),大多数蛋白质能与SDS按一定比例结合,即每克蛋白质结合1.4g的SDS-复合物都带上相同密度的负电荷,它的量大大超过了蛋白质分子原有的电荷量,因而消除了蛋白质原有的电荷差别,使蛋白质分子电泳的迁移率主要取决于本身的分子量,而与蛋白质所带的电荷无关,在一定条件下,蛋白质的分子量的对数与电泳迁移率间呈负相关。
操作步骤
1、凝胶制备:
用两块电泳玻璃板制成垂直板槽(不能漏胶),垂直放置。将配制好的分离胶溶液倒入,滴加入无离子水,待凝胶聚集后,倒出无离子水,用吸水纸吸干,倒入浓缩胶,再插入梳子。
2、上样:
分别取样品若干ml于离心管中,按1/1~1/5比例加入5×样品缓冲液,再沸水浴中加热3~5min,取出待用。用微量注射器分别吸取不超过30μl不同浓度的标准蛋白样品和试验样品注入样品槽。点样结束后,调节电泳仪电流到10mA(2~3mA/em),保持电流稳定不变,当溴酚蓝迁移到离分离胶底1~2cm时,即可停止电泳。
3、染色:
电泳完毕后,取出凝胶板,浸入染色液中,在37℃温箱中保温过夜。倒掉染色液,24h后,即可看到清晰的蛋白质条带。
sds:变性剂,用来变性蛋白和破坏蛋白二级结构。
AB:凝胶前体
AP和TEMED用来聚合凝胶。
SDS聚丙烯酰胺凝胶电泳的英文缩写是sds-page
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