空间表型正在改变现有的方法,借助它能够绘制出癌症进展的景观
空间生物学已经成为癌症研究的有力工具,使研究人员能够研究细胞如何在肿瘤微环境中组织和相互作用,并最终揭示癌症进展和治疗的机制。Akoya Biosciences非常兴奋地首次展示在PhenoCycler-Fusion单细胞原位空间组学分析系统上获得的全新的整张组织片上103 个标志物的数据集。
1. 快速、深入的100个标志物空间表型分析揭示免疫治疗反应的可能机制
需要多少标记物才足以表征肿瘤的形态? Akoya应用团队和澳大利亚昆士兰大学的合作者采用单细胞分辨率在整张组织片上绘制了惊人的103个标记。这项研究的数据以海报的形式在美国癌症协会年会AACR上展示。
根据癌症的特征,细胞谱系、免疫激活和检查点、细胞能量学等标记物的103个抗体组合在PhenoCycler-Fusion上运行。每个标记都经过精心挑选,以揭示不同途径的独特信息,当这些标记组合在一起时,共同揭示了免疫、压力和代谢特征的独特见解,提供了癌症进展全景的综合概述。
2. 超高参数空间表型提高了病理学家的注释能力,并提供了更多的免疫反应机制的细节
将该抗体组合用于人口咽鳞状细胞癌的福尔马林固定石蜡包埋(FFPE)组织样本分析时,作者发现了14种不同的细胞类型。深度空间表型使他们能够看到整个肿瘤组织的复杂形貌特征。全片分析发现组织内4个不同的肿瘤区域含有不同丰度的免疫细胞、增殖细胞、上皮细胞和血管细胞。
作者确定了不同的免疫细胞浸润vs代谢标志物表达模式,与每个肿瘤区域假定的免疫过程相对应。肿瘤区域不同的表达谱有助于解码头颈部肿瘤免疫治疗反应的机制。例如肿瘤4区具有较高的免疫浸润性,而肿瘤3区相对较冷,免疫细胞穿透性较低。
这项在2天内完成的研究表明,快速、全片、超高参数的空间表型对于绘制肿瘤结构和揭示临床反应和治疗耐药性背后的机制增加了探索性分析的价值。关于这项研究的更多细节可以在我们的海报上找到。
3. 空间表型正在改变现有的方法,借助它能够绘制出癌症进展的景观
Akoya首次展示了在PhenoCycler-Fusion单细胞原位空间组学系统上获得的103个标志物抗体组合设计和空间表型数据,并揭示:
• 为什么超高参数空间分析对于表征肿瘤微环境的复杂形貌至关重要
• 基于癌症特征的103个标志物的抗体组合如何在口咽鳞状细胞癌样本中揭示独特的免疫、代谢和应激特征
• 如何通过PhenoCycler-Fusion单细胞原位空间组学分析系统从人FFPE组织中实现快速、深入的单细胞空间表型分析
欢迎联系Akoya Biosciences获得更多信息。
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