Nat Commun：新型活检技术或有望分析多种肿瘤组织中的特殊生物标志物

2022年1月14日 讯 /生物谷BIOON/ --在空间背景下的多路复用mRNA分析或能提供促进基础研究和临床应用的新信息，然而不幸的是，现有的空间转录组学方法由于多路复用率较低或复杂性而受到了一定的限制；近日，一篇发表在国际杂志Nature Communications上题为“Spatial transcriptomics using combinato

2022年1月17日 讯 /生物谷BIOON/ --在空间背景下的多路复用mRNA分析或能提供促进基础研究和临床应用的新信息，然而不幸的是，现有的空间转录组学方法由于多路复用率较低或复杂性而受到了一定的限制；近日，一篇发表在国际杂志Nature Communications上题为“Spatial transcriptomics using combinatorial fluorescence spectral and lifetime encoding， imaging and analysis”的研究报告中，来自加利福尼亚大学等机构的科学家们通过研究开发了一种新型的活检技术，其或能同时对多个肿瘤微环境生物标志物进行分析，并揭示细胞的空间组织和相互作用，进而帮助推进个体化的疾病诊断和治疗；当前的单一生物标志物活检技术并不能分析多种不同的生物标志物且经常不能成功预测患者的预后。

MOSAICA方法的示意图，其用于标记和分析光谱和时间分辨率组分。

图片来源：DOI: 10.1038/s41467-021-27798-0

这种称之为多组学、利用整合组合分析来进行单次扫描的基于荧光成像的技术（MOSAICA）或能对细胞和组织中大量的mRNA和蛋白质标志物进行空间分析，包括临床肿瘤组织；这篇研究报告中，研究人员表示，MOSAICA技术能够在3D空间范围内利用单轮染色和成像直接进行高度多路复用的生物标志物分析，而并不是传统方法中通常需要重复的多个处理步骤。

如今临床医生和科学家们对肿瘤组织中不同的免疫细胞和癌细胞类型有了一个整体的看法，这或许就为确定病人的预后和疗法治疗效果提供了新的线索和思路；研究者Weian Zhao说道，空间生物学是一个新的科学前沿领域，其能在分子和组织水平下绘制出每个细胞及其在体内的功能，而这或许是理解人类疾病并开发精准化诊断和治疗性策略的基础。包括免疫检查点抑制剂在内的许多癌症免疫疗法并不会发挥作用，而科学家们意识到，这或许是因为所有肿瘤组织细胞类型的空间组织或许会决定药物的疗效；而本文中研究者所开发的MOSAICA技术则能描述活检肿瘤组织免疫微环境中的空间细胞组成和相互作用，从而就有望为个体化诊断和疗法提供相应的信息。

图片来源：https://www.nature.com/articles/s41467-021-27798-0

综上，本文研究结果表明，科学家们有望利用其所开发的MOSAICA技术来对临床上黑色素瘤福尔马林固定石蜡包埋（FFPE）的组织进行多重分析，最终或有望证明能在癌细胞中同时对蛋白质和mRNA进行检测。（）

原始出处：

Vu, T., Vallmitjana, A., Gu, J. et al. Spatial transcriptomics using combinatorial fluorescence spectral and lifetime encoding, imaging and analysis. Nat Commun 13, 169 (2022). doi：10.1038/s41467-021-27798-0